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arrow 土壤
Q. 从土壤中提取DNA平均得率是多少?
A. 土壤DNA得率受多种因素影响,如质地、水分、pH值、碳含量及采样土层深度等,使得率难以预计。堆肥和上层表土得率最高,粘土和底泥得率最低。在我们实验室,每0.25g肥沃土壤常能获3-6μg DNA。相当于12-24μg DNA每克土样。曾经提取过最丰富的土样类型,能获得10μg DNA每0.25g土样。而粘土、砂土、底泥沉积物及某些类型的农业土壤,每0.25g只能获得250-500ng DNA。
Q. 预计能从土壤中获得多少RNA?
A. 通常土壤RNA得率远低于DNA,约为后者的10~20%。详见上文DNA平均得率。
Q. PowerSoil® 和 PowerLyzer™ PowerSoil® Kit有什么区别?
A. PowerSoil® DNA Isolation Kit (货号:12888)和PowerSoil® DNA Isolation Kit (货号:12855)主要区别在于研磨珠套管。PowerSoil® Kit用的是0.7mm石榴石研磨珠,而PowerLyzer™ PowerSoil® Kit用的是0.1mm玻璃研磨珠。根据你的土样类型、研磨速度和研磨设备来选择该用哪款盒子。首次拿到土样,建议用两种类型的研磨珠,做梯度研磨速度比较,看哪个条件在保证DNA完整性情况下获得最高得率。通常使用桌面研磨设备(如PowerLyzer™ 24 High powered Benchtop Homogenizer)用玻璃研磨珠,以3200rpm提取DNA,可获得最大的DNA得率和最好的完整性。而用一般的涡旋仪,两种研磨珠无显著差异。检验DNA得率建议同时跑电泳和测OD。因为小片段DNA会抬高260nm读数,所以不能作唯一评判标准。详细试验报告点击这里这里
Q. 应该用哪种方法研磨我的土壤样本?
A. 再次回答这个问题。最好的研磨方法因土样而异。新土样最好能用两种不同的研磨珠以及提取研磨速度做提取比较,找出DNA完整性最好且得率最高的方案。一个通用法则就是,对于疏松、颗粒状和富含有机质的土样从较低转速开始尝试(PowerLyzer™24 High Powered Beachtop Homogenizer上2500rpm 45s一个循环);粘土从较高转速开始(尝试(PowerLyzer™24 上4000rpm 45s一个循环)。玻璃研磨珠在高速珠磨研磨(>3500)环境下能保证DNA完整性前提下获得更高得率。最终DNA分析建议结合凝胶电泳和测OD值。较高的OD值并不一定代表好的结果,大量破碎的小片段DNA会推高260nm读数。详细试验报告点击这里
Q. 如何获得最高的土壤DNA得率?
A. 为了获得土样最高DNA得率,建议使用PowerLyzer™ PowerSoil® DNA Isolation Kit (货号:12855-50)结合高速珠磨研磨机PowerLyzer™ 24 High powered Benchtop Homogenizer (货号:13155)。大量不同类型土样试验点击这里。对不用微生物丰度土样进行各种研磨方案比较,最终发现玻璃研磨珠(0.1mm)结合PowerLyer™24能获得最大的DNA得率,高碳含量土样除外。通过增加加样量至500mg也可能可以提高DNA得率。但注意必须保证珠磨研磨时有足够液体。必要时每管加入100-200μl裂解缓冲液(货号:12855-50-BS,另售)。高水分含量的样品,可先离心并尽可能去掉上清。总之一条,保证珠磨研磨并离心后,可转移的上清不少于400μl且不多于600μl。详见应用报告
Q. 我要检测土样中的真菌DNA。如何确保孢子都被裂解了
Q. PowerFecal® DNA Isolation Kit与PowerSoil® DNA Isolation Kit有什么区别?
Q. PowerFecal® DNA Isolation Kit可以与PowerSoil® DNA Isolation Kit互换使用吗?
Q. 我能增加土壤加样量吗?
A. PowerSoil® DNA Isolation kits最好加入不超过250mg的土样。然而,如果你的土样水分含量很低,也有可能可以最多加到500mg。过大的土样体积有可能使得珠磨研磨过程水量不够。以研磨离心后可转移的上清至少有400μl为下限。必要时也可以单独购买裂解缓冲液(货号12855-50-BS),每管加入100-200μl
Q.我在使用PowerSoil® DNA Isolation Kit提取低生物丰度的砂土。如何提高得率?
A. 对于生物丰度低、腐植酸含量也低的土样,你可以简化Inhibitor Removal Technology®(IRT) 步骤。具体说,C2溶液减少到100μl,然后直接加100μl C3溶液,4℃孵育5min,接着进行C3后面的步骤。可简化可能降低DNA得率的步骤。因为溶液容量减少了,珠磨研磨离心后的600μl上清都可以转移来提DNA。
Q. 如何确定使用MOBIO的土壤DNA/RNA提取盒子的核酸提取效率?
A. 人们常问我们,如何提取土样中的所有DNA,尤其是那些低得率类型的土样。因为土样特性不一而终,pH值、腐植酸、碳含量,所以最好能用试剂盒提取一个已知细菌含量的样品,作为标准对照。你可以提1mL大肠杆菌纯培养。已知1mL大肠杆菌过夜培养液大约含109个细胞,或者说大约5μg DNA。取新鲜过夜大肠杆菌培养液离心去掉上清,100μl PBS缓冲液重悬,加入到土样中,孵育10分钟过后进行提取。
Q. 使用PowerSoil® DNA Isolation kit提取土壤DNA。说明书上说加入C2溶液并离心后最多只转移其中600μl上清到一个新的Tube管中。实际操作上发现上清不止600μl。可以转移所有上清吗?我不想丢弃任何DNA。
A. 你可以转移多于600μl的上清液。不过,C3步骤后转移的上清量不能超过750μl,否则关键溶液C4将没办法全加进去。如果你发现C3步骤后上清液太多,可以在提取DNA开始前先取出200μl Bead Beating Tube中的裂解缓冲液。要是土样本来含水量很高,也可以在加样前先行离心,尽可能去除游离水分。
Q. 使用MOBIO的PowerSoil® Total RNA kit发现RNA有降解,怎么办?
A. 建议在加入Bead Solution、SR1、SR2到Tube管之后,就马上加入苯酚溶液。不要等样品化冻。有些样品含有大量死细菌和RNase,RNA特别容易降解。
Q. 我可以用RNALater®或RNAProtect®保护土样中的核酸吗?
A. 不可以!这些试剂进入到土样以后很难清除掉。残留的保护液会严重影响DNA和RNA的提取。建议使用MOBIO的LifeGuard Soil Preservation Solution。它可以在零下20℃储存运输过程中保护土壤核酸长达30天。详细试验报告点击这里这里。
Q. PowerSoil试剂盒上说只提取DNA,但我并没看到RNA清除步骤。有这样的措施吗?我该在什么时候加入RNase?
A.这款试剂盒不带RNase,因为硅胶离心柱不会吸附低分子量核酸,RNA会被冲洗掉。通常点用上极少会看到可见的RNA。但个别情况下有可能残留少量RNA。如果下游实验需要绝对去除RNA,可在实验开始的时候往研磨管中加入1μl RNase。
Q.我们实验室没有大型的珠磨研磨机,而且我的土样得率很低,怎么破?
A.是的,对于低微生物丰度的样品我们有修改版的说明书通过加入苯酚:氯仿:异戊醇,pH7-8 和100%乙醇,可以提高DNA的得率。具体请联系anbiosci@126.com
arrow 微生物
Q. 使用UltraClean Microbial DNA Isolation Kit 微生物DNA提取试剂盒的一般得率是多少?
A. DNA得率会随着微生物类型不同和生长情况变化而变化。通过Nanodrop测定,一般1.8ml纯培养的得率,大肠杆菌为14μg、粪肠球菌11μg、枯草杆菌5μg、白念珠菌μg。上述数值可能包含少量RNA。
Q. 我想从受感染组织中提取微生物DNA,应该使用哪款试剂盒?
A. 虽然UltraClean Tissue & Cells DNA Isolation Kit组织细胞DNA提取试剂盒起初是设计用于体细胞DNA的提取,但它同样适合用于微生物细胞。珠磨研磨步骤中使用的0.7mm石榴石研磨珠,能很好地裂解革兰氏阴阳性菌和真菌。为了最大限度减少组织细胞基因组DNA,可省略蛋白酶K消化步骤。
Q. UltraClean® Microbial DNA isolation Kit既能提基因组DNA也能提质粒DNA吗?
A. 虽然UltraClean® Microbial DNA isolation Kit专门对提基因组DNA进行了优化,但也会共分离质粒DNA。通常小片段DNA和RNA(< 3kb)绑定效率不高。通过下面可选步骤可提高小分子量核酸的回收率。常规提450μl微生物裂解物需要加入900μl MD3,此时增加MD3用量至1.2ml。请电泳检测最终提取效果。
Q. 我用 UltraClean® Microbial DNA Isolation Kit处理大量样本。哪一个步骤可以中间暂停?
A. 加入MD2后可暂停实验。把样品4℃存放数小时至过夜都没有问题。
Q. 我在用UltraClean® Microbial DNA Isolation Kit,而最终DNA的260/280、260/230比值总有问题。我该如何提高洗脱DNA的浓度?
A. 洗脱前用MD4溶液或80%乙醇作二次冲洗。然后延长13000g离心时间至2min,以充分甩干残留冲洗缓冲液。洗脱前晾干离心柱。
Q. 使用UltraClean Microbial DNA Isolation Kit 微生物DNA提取试剂盒的一般得率是多少?
A. DNA得率会随着微生物类型不同和生长情况变化而变化。通过Nanodrop测定,一般1.8ml纯培养的得率,大肠杆菌为14μg、粪肠球菌11μg、枯草杆菌5μg、白念珠菌μg。上述数值可能包含少量RNA。
arrow 水样
Q. 我应该用PowerWater®还是 RapidWater®DNA Isolation Ki?
A. PowerWater® DNA Isolation Kit使用了我们的专利Inhibitor Removal Technology® (IRT)技术,非常适合含有大量溶解有机物和重金属的浑浊水样。如果你的水样来自于干净的地下水或饮用水,使用RapidWater™ DNA Isolation Kit可更快速简单地提取到DNA。若你仍不能确定该用哪款产品,那推荐首选PowerWater® DNA Isolation Kit。
Q. 我可以用自己的水样滤膜吗?还是说只能订购MOBIO的?
A. 我们的水样提取试剂盒可适应包括聚醚砜、醋酸纤维素、硝化纤维和聚碳酸酯等在内的各种商业化滤膜。只要滤膜直径不大于47mm,就都能兼容MOBIO的 PowerWater®和RapidWater™ DNA Isolation Kit。
Q. 使用 PowerWater® DNA Isolation kit能同时提取DNA和RNA吗?
A. PowerWater® DNA Isolation kit专门优化用于提取DNA。提取滤膜RNA,建议使用PowerWater® RNA Isolation Kit(MO BIO货号:14700)。想同时提取DNA和RNA,用PowerWater® RNA Isolation Kit提取时省略说明书上的19-23步。
Q. PowerWater® DNA Isolation kit只能提取水样滤膜的DNA吗?过滤空气的滤膜能提不?
A. 能,PowerWater® DNA Isolation Kit可以提取所有微生物滤膜,无论液体还是空气。还做过尿液、下水道污水、污浊空气和油井油污水。
Q. 我可以用PowerWater® DNA Isolation Kit提取其它类型的滤膜吗?比如说Millipore的Sterivex™或SteriPak™。
A. 可以的。Sterivex™和SteriPak™的滤膜都能用PowerSoil®或RapidWater™提取DNA。需要事先破开过滤装置容器,取出滤膜,剪碎后放入试剂盒Bead Tube中。另,货号为14600的试剂盒可无需破开Sterivex™的过滤装置,直接提取滤膜中的微生物DNA。
Q. 我有一些冷冻的水样,可以用PowerWater® DNA Isolaiton Kit提取吗?
A. 反复冻融的水样中的微生物也会遭受破坏,这将导致其无法通过过滤吸附到滤膜上,从而可能损失部分核酸。小体积的水样(如经过沉淀或离心的浓缩水样)可用PowerSoil®或PowerMax® DNA Isolation Kit(MOBIO货号12888、12988)。或者可以把水样过滤到滤膜上再行冷冻。有些人直接把过滤好的滤膜放进PowerWater®的Bead Tubes,冷冻保存,需要提取的时候就无需转移了。
Q. 提取前如何保护水样中的DNA?
A. 最好的保存方法是滤膜过滤水样,放进干燥的PowerWater® Bead Tube中,-20℃保存。如果没条件冷冻,滤膜过滤后放入Bead Tube保存前用真空泵尽可能抽干。
Q. 我没办法把大量水样带回实验室处理。在野外,有好的办法收集水体微生物到滤膜上吗?
A. 我们很多客户在采样点用Sterivex Filter Units过滤大量的水(1-10L)。建议使用PowerWater® Sterivex DNA Isolation Kit快速方便地提取Sterivex Filter Units高质量基因组DNA。
Q. 我们使用PowerWater® Sterivex™ DNA Isolation Kit需要用到vacuum manifold吗?
A. 是的,需要使用vacuum manifold帮助裂解物吸附到过滤柱上。
Q. 我的水样过滤在Sterivex™ units中,并加入SET(蔗糖、EDTA、Tirs)裂解缓冲液保存。还能用PowerWater®Sterivex™ DNA Isolation Kit提它的DNA吗?
A. 该缓冲液中的EDTA会跟试剂盒中的某些化学物起反应,影响抽提的正常进行。你需要先去掉SET缓冲液才能用MOBIO的PowerWater®Sterivex™ DNA Isolation Kit。EDTA会分解经冷冻的Sterivex滤膜上的微生物,裂解细胞的DNA游离在缓冲液中。建议干燥保存Units,提取时依照说明书步骤,能获得比常规酶法更高的得率。详细试验报告点击这里
Q. 我的水样没有过滤在滤膜上,而是浓缩成很小的体积。该用哪款试剂盒?
A. 可以有多种选择。如果你主要为了研究其中的细菌DNA,可把水样中的细胞沉淀下来,用我们的微生物试剂盒,如UltraClean® Microbial DNA Isolation Kit or the PowerLyser™ UltraClean® Microbial DNA Isolation kit来提。然而此方法对留在上清中的病毒DNA无效。你可以不经过滤用PowerWater® DNA Isolation kit提取。加入的裂解缓冲液减少200-400μl,使得珠磨研磨裂解离心后可用上清总量(裂解缓冲液+水样)不多于600-650μl。
Q. 有办法用PowerWater® Sterivex™ DNA Isolation Kit从Sterivex Filters中提取RNA吗?
A. 有的。我们有可选步骤用于使用PowerWater® Sterivex™ DNA Isolation Kit提取Sterivex Filters中RNA的办法。请联系技术部获得相关步骤说明。
Q. 从哪里可以买到Sterivex™ water filters?
A. Millipore Sterivex water filter units (Millipore 货号:SVGPL10RC)可直接从Millipore或其代理商购买。
Q. 没有Luer-Lok® outlet公头的Sterivex过滤器可以使用Sterivex™ water Kit吗?
A. 可以的。只要这款Sterivex过滤器有公短嘴就能兼容这款试剂盒。只不过你需要想其它办法封闭过滤器出口。有些客户使用Hemato-Seal Capillary Tube Sealant(Fisher货号:02-678)。另一个方法是切下一半注射器的盖帽用作出口的封口帽。
arrow 粪便
Q. PowerFecal® DNA Isolation Kit和PowerSoil® DNA Isolation Kit两款试剂盒有什么区别?
Q. PowerFecal® DNA Isolation Kit可以与PowerSoil® DNA Isolation Kit互换使用吗?
Q. RNA PowerSoil® Total RNA Isolation Kit和PowerMicrobiome™ RNA Isolation Kit有什么不一样?
Q. 我想提取禽/鸟的排泄物DNA,该用哪款试剂盒?
A. 我们建议使用PowerLyzer™ PowerSoil® 或PowerSoil® DNA Isolation Kits。他们都有最强力的抑制因子去除步骤。前者使用了0.1mm玻璃研磨珠,在某些场合下能获得比原型试剂盒PowerSoil®kit(0.7mm石榴石研磨珠)更高的得率。在它们之间进行选择取决于样品和微生物类型。很多研究粪便和肠内容物的客户在涡旋振荡前65℃水浴样品10-15min以增强细胞裂解效果。
Q. 我有一些保存在含1%β-巯基乙醇硫氰酸胍溶液(GTC)的粪便样品。我可以用GTC代替Bead Tube中原有的裂解缓冲液吗?
A. 不能,高浓度硫氰酸胍的缓冲液会影响抑制因子去除试剂发挥作用。最好先离心去掉上清缓冲液,再重悬到Bead Tube的裂解缓冲液中。
Q. 我想同时提取一个粪便样品中的DNA和RNA,该用哪款试剂盒?
A. 有两种选择可同时提取一个粪便样品中的DNA和RNA。我们有RNA PowerSoil® Total RNA Isolation Kit (12866-25)结合另一款辅助DNA提取盒子(12867)可分别洗脱同一个柱子上的DNA和RNA。这款盒子最大加样量是2g。你也可以用PowerMicrobiome™ RNA kit把DNA和RNA同时从硅胶离心柱上洗脱下来,后期根据需要用DNase/RNase消化处理。PowerMicrobiome™ RNA kit提取速度更快,价格更便宜。
Q. 我按照人类微生物组计划的操作指南提取粪便样品,里头提到了MOBIO的PowerSoil和"MOBIO Lysis Buffer"。我在网站上没找到后者的链接。
A. 人类微生物组计划的操作指南中提到的"MOBIO Lysis Buffer"指的是 我们的PowerSoil Bead Solution。可以单独订购,货号为12855-50-BS,42ml装。
Q. 如何采集和保存用于DNA/RNA提取的粪便样品?
A. 粪便微生物群落结构在室温下长达两周时间仍能保持稳定。所以,我们建议用Bead Tubes收集样品,使用普通冰袋保温运输,并于-20℃冷冻保存。避免反复冻融。要了解更多细节,请查看粪便样品的保存与运输
arrow 植物
Q. 我可以用PowerPlant RNA Isolation Kit提取microRNA和siRNA吗?
A.PowerPlant RNA kit只需对操作流程稍作修改就能很好地回收到小片段RNAs。为了加大mciroRNA和siRNA的回收率,在吸附RNA到离心柱上前的步骤,加大100%乙醇用量650μl。其它步骤不变。
Q. 所有类型植物样品都可以通过添加PSS(酚类分离溶液)来增加核酸得率吗?
A. 不能。植物样品酚类含量差异很大。有些植物样品(如葡萄叶、草莓叶、番茄茎、松针)富含酚类复合物,严重影响DNA/RNA提取。加入PSS溶液能去除酚类复合物并提高核酸得率。然而,如果植物样品酚类含量不高(如棉花种子、草叶、稻叶、薄荷叶),加入PSS反而会降低得率。不是所有植物样品都富含酚类,因此是否需要添加PSS取决于研究的植物哪个部位。如果你能确定特性样品酚类含量,做个对比实验即可。
Q. 我需要像其他大多数说明书描述的那样,珠磨研磨前加热样品吗?
A. 不必要。我们实验发现使用PowerPlant Pro,并非所有样品都要在珠磨研磨前水浴加热。有些样品比如棉花叶、草、松针和葡萄叶等加热后还会降低得率。建议对你特定的样品做加热/不加热对比实验。
Q. 我要提取木头/根部的微生物DNA,正担心样品中可能富含的多糖多酚对DNA的影响。该用哪款适合?
A. 推荐使用PowerPlant Pro Kit。这款试剂盒使用的是2.38mm不锈钢研磨珠,可以高效均质化植物样品,裂解坚硬木头/根部等坚硬类型样品释放出潜藏的微生物DNA。
arrow 动物组织细胞
Q.我可以用BiOstic FFPE Tissue & Cells DNA Isolation Kit提取的DNA做第二代测序吗?
A. 是的。用BiOstic FFPE Tissue & Cells DNA Isolation Kit提取的DNA能成功进行PCR、qPCR和第二代测序实验。需要注意的是BiOstic FFPE Tissue & Cells DNA Isolation Kit能高效轻柔地去除影响下游实验的污染物,过程对DNA质量没有影响。如果FFPE组织切片中DNA已经降解,那么出来的DNA也不会有所改变。
Q. BiOstic FFPE Tissue & Cells DNA Isolation Kit可以提RNA吗?
A. 可以。我们有可选操作步骤可以用BiOstic FFPE Tissue & Cells DNA Isolation Kit提取RNA。你需要对实验做如下修改:
1)需要一种裂解缓冲液能在加热溶解组织石蜡解除蛋白-DNA交联提取过程中保护RNA。我们使用PowerBiofilm DNA Kit的BF2溶液(独立货号:24000-50-2)。每样加200μl BF2 替代原来的FP1和FP2,然后加入20μl FP3,60℃消化1h。
2)降低去蛋白-RNA交联温度到70℃ 30min(提DNA需90℃ 60min)。此步只针对石蜡包埋样品,福尔马林固定的略过。
3)第七步加入FP4和1.5倍体积的100%酒精(300μl)代替原来的200μl FP5.若要增加miRNA和siRNAs的回收率,可适用2倍体积100酒精。
4)若只要RNA,可使用On-Spin Column DNase Kit(货号:15100)在硅胶滤膜洗脱前移除基因组DNA。
或者用BiOstic FFPE Tissue & Cells RNA Isolation Kit
Q. 使用UltraClean Tissue & Cells RNA Isolation Kit提取组织RNA需要用到强力珠磨研磨设备吗?
A. 不一定;但强力珠磨研磨是最快最简单的方法。其它研磨方法可用液氮+手工研磨。RNA提取过程,必须快速研磨样品,尽可能避免RNA过热和降解。强力珠磨研磨设备还能一次处理大批样品同时保持RNA的完整性。详细试验报告请点击这里
Q.我可以用UltraClean Tissue & Cells DNA Isolation Kit提取昆虫DNA吗?
A. 可以,像昆虫这样坚硬的样品请用试剂盒提供的蛋白酶K消化,并在高速珠磨研磨设备上3个20s循环(PowerLyzer™3100rpm,Fastprep 或 Precellys 6100rpm)。
Q. 我想提取感染组织的微生物DNA,该选用哪款试剂盒?
A. 虽然UltraClean Tissue & Cells DNA Isolation Kit的设计是要提取体细胞DNA,但其实它也可以用来提微生物细胞。试剂盒所使用的0.7mm石榴石研磨珠可以有效裂解革兰氏阴性细菌、革兰氏阳性细菌,甚至真菌。为尽可能减少提取到组织DNA,请跳过蛋白酶K消化步骤。
arrow 棉拭子
Q. 我想提取棉拭子上含PCR抑制因子的微生物DNA,有什么好建议吗?
A. 有些棉拭子样本含有PCR抑制因子。比如说直肠拭子的排泄物,环境表面的棉拭子。提取这类棉拭子的细菌DNA,建议使用BiOstic Bacteremia Kit。此试剂盒含有我们的专利IRT技术去除PCR抑制因子,还有强力的裂解缓冲液。使用这款试剂盒提取棉拭子,你需要做以下步骤:
1)加入450μl CB1缓冲液到MicroBead Tube中;
2)把棉拭子放入并在缓冲液中搅拌,浸泡数分钟释放其中的细胞;
3)可以的话摘下棉拭子头部并留在Tube管里,否则把棉拭子按压Tube管壁尽可能挤出水分,丢弃棉拭子。
4)进行70℃水浴步骤,余下步骤正常操作。
Q. 我想提取收集在棉拭子上相对比较干净含极少PCR抑制因子样品的微生物DNA,有什么好建议吗?
A. 不含PCR抑制因子的样品建议用UltraClean Tissue and Cells DNA Isolation Kit。它有2ml研磨珠套管和强力裂解缓冲液高效裂解原核细胞。使用这款试剂盒提取棉拭子,你需要做以下步骤:
1)加入700μl TD1溶液到2ml Bead Tube中;
2)把棉拭子放入并在缓冲液中搅拌,浸泡数分钟释放其中的细胞;
3)可以的话摘下棉拭子头部并留在Tube管里,否则把棉拭子按压Tube管壁尽可能挤出水分,丢弃棉拭子。
4)涡旋混匀破碎处理,余下步骤正常进行。
Q.我想提取收集在棉拭子上含有PCR抑制因子的人类/宿主DNA。有什么好建议吗?
A. 如果样品含有大量抑制因子,而你想要的是人类DNA(比如说,棉拭子采样前该人忘记禁食),建议使用BiOstic Bacteremia Kit。此试剂盒含有我们的专利IRT技术去除PCR抑制因子,还有强力的裂解缓冲液。用这款试剂盒提取棉拭子,你需要做以下步骤:
1)不要用Bead Beating Tube。加入450μl CB1溶液到一个标准2ml 小型离心管中,放入棉拭子并搅拌,浸泡数分钟释放细胞。
2)棉拭子按压离心管壁,尽可能挤出水分,丢弃棉拭子。
3)涡旋混匀10s,70℃水浴15min。另外,你可以可以加入10μl蛋白酶K来加强细胞裂解。
4)加入100μl能去除PCR抑制因子的CB2溶液,余下步骤正常进行。
Q. 我想提取收集在棉拭子上相对干净不含PCR抑制因子的人类/宿主DNA。有什么好建议吗?
A. 如果你要提取棉拭子上不含PCR抑制因子的真核生物/宿主DNA,建议用Blood Spin DNA Kit。使用这款试剂盒提取棉拭子,你需要做以下步骤:
1)把棉拭子浸泡在400μl TE缓冲液中(10mM Tris,1mM EDTA);
2)棉拭子浸泡在缓冲液中数分钟释放细胞;

3)可以的话摘下棉拭子头部并留在Tube管里,否则把棉拭子按压Tube管壁尽可能挤出水分,丢弃棉拭子。
4)加入400μl B1溶液,再加入10μl 蛋白酶K,60℃水浴消化30min;
5)若棉拭子头部还在Tube管中,贴壁按压挤出水分,丢弃。加入800μl B2溶液(100%酒精),用两个离心柱,每管加入600μl上述溶液,绑定DNA到离心柱上;
6)余下步骤正常进行。
Q. 我想提取口腔或排泄物棉拭子RNA,该用哪款产品?
A. PowerMicrobiome RNA Isolation Kit设计用于快速简便提取富含PCR抑制因子样品的总RNA。Bead Tube加入650μl PM1/βME溶液,再放入冷冻的棉拭子,任其融化。
2)在缓冲液中搅动棉拭子,浸泡数分钟释放细胞
3)可以的话摘下棉拭子头部并留在Tube管里,否则把棉拭子按压Tube管壁尽可能挤出水分,丢弃棉拭子。余下步骤正常进行。
arrow 生物薄膜
Q. 什么样的样品才需要用到PowerBiofilm DNA Isolation Kit?
A. 生物薄膜(Biofilms)可以在水管里头、泻湖岩石、小溪岩石上找到,多重生物薄膜层叠称作生物垫(Microbial Mats)。生物薄膜由多种细菌不可逆地与胞外聚合物(EPS)粘连而成。EPS基质吸附大量腐殖质、重金属、盐类和杀虫剂等,使得生物薄膜中的微生物很难裂解,且核酸与抑制因子极易交联。这也是市面上大多数商业化核酸提取试剂盒未能成功的原因。PowerBiofilm® DNA/RNA Isolation Kit提取核酸前有专门的biofilm预处理步骤,结合强力的细胞裂解缓冲液和专利IRT®技术,最终可获得高质量不含抑制因子的DNA和RNA。详细试验报告请点击这里
Q. PowerBiofilm 和PowerSoil Kit有什么不同?
A. PowerBiofilm DNA Isolation Kit含有一种独特化学试剂用于溶解生物薄膜上的EPS,还有混搭研磨珠套管专门裂解微生物垫。两个盒子都有IRT技术,使用了二氧化硅滤膜离心柱回收DNA。更多深入了解两者区别请点击这里
arrow 食物
Q. 我想提取发酵乳制品中的DNA,然后做DGGE分析。该用PowerFood还是PowerMicrobial DNAIsolation Kit?
A. PowerFood Microbial DNA Isolation Kit更擅长去除牛奶中的抑制因子,推荐用它来提取发酵乳制品DNA。
Q. 我想提从未经培养的食物样品(面包面团、牛奶、果汁、狗粮、啤酒等)提取真菌DNA。样品含有大量淀粉、蛋白和脂肪等抑制因子。可以用PowerFood Microbial DNA Isolation Kit吗?
A. 是的,你可以用PowerFood Microbial DNA Isolation Kit提取固体、液体样品(富含抑制因子)微生物DNA。详情可见试剂盒说明书的疑难点。
arrow 病毒
Q. 我们想用MOBIO 的PowerWater DNA Isolation Kit提取水样中的病毒DNA/RNA。可是病毒颗粒太小,无法用0.2μm水样滤膜捕捉。我该用哪款试剂盒?
A. 要提取液体中病毒的DNA/RNA,需要把液体浓缩到一个很小的体积。建议至少浓缩到200μl以下以免稀释掉裂解缓冲液。对于水样的浓缩,可以用一款经过MgCl2特殊处理的0.02μl孔径氧化铝滤膜或其它带正电荷高吸附性的介质。请详细我们的博文了解更多内容。
arrow PowerMag 试剂盒
Q. 我们想用MOBIO 的其中一款PowerMag试剂盒,但实验室没有epMotion或KingFisher的机器。有另外一款类似的仪器,可以吗?
A.也许可以。我们没有其它机器的程序文件,但有个简化版的机器指令PDF文档。如若需要可以发给你,然后修改相应程序以适应你的机器。有更多问题,请随时联系技术部。
Q. 我现正使用一款针对KingFisher机器定制的PowerMag 试剂盒。机器运行的程序版本是3.1,能识别的操作说明书格式是".msz"。可MOBIO网站上下载到的文件格式是".bdz",还能用吗 ?
A.你需要联系Fisher Scientific获取最新版本的程序来识别bdz文件。目前没有软件可以相互转换msz和bdz
arrow 其它
Q. MOBIO的试剂盒保质期有多长?
A.MOBIO生产的所有试剂盒都有保质期标注在包装盒上。如果你只有一瓶单独的组分,请告诉技术支持该组分的批号,我们可以告诉你具体保质期。使用过期产品可能影响使用效果。
arrow 运输
Q. 我使用MOBIO的其中一款DNA提取试剂盒提取DNA。现在需要把DNA长途运输到目的地。可以提供关于DNA保存的技巧吗?
A.运输途中,保存在离心管或96孔板中的重悬DNA,很容易降解或者交叉污染。为了避免出现这种情况,必须采取相应措施。地球微生物组计划把保存在96孔板或离心管的DNA的打包保存方法收集了一下,你也关注一下,挺有用的。
arrow 仪器设备
Q. 什么是涡旋仪适配器?
A. 它是用来水平固定Tube管的涡旋仪附件。可使样品获得高效、均一的研磨均质效果,取代人工点振法。MOBIO生产了一系列适合2-50ml不同大小Tube管的适配器。详细介绍请点击这里
Q. MO BIO的PowerLyzer™24是一款怎么样的仪器?
A.PowerLyzer™24 Bench TopBead-Based Homogenizer是一款强力的珠磨研磨设备,专用于高效裂解均质化所有类型生物样品。可以在不到30s时间快速处理24个2ml 研磨管。结合MO BIO的高质量核酸提取试剂盒,可简便快速提取任何坚硬、难提取的样品,如松针、种子、孢子、真菌垫和皮肤组织等。
Q. 新买的MO BIO适配器无法固定在涡旋仪上,怎么办?
A.  很多新用户未接触过涡旋仪适配器,害怕用力过猛弄坏它。而安装适配器需要一定的技巧,对齐接口往下按,听到"咔"一声即可安装完成。请联系QQ:85452068索取相关演示视频。
Q. MOBIO的适配器很难拔下来,怎么回事?
A.  如果你是新手没接触过涡旋仪适配器,卸载时需要一定的技巧。双手拇指放在适配器黑色顶帽上,其余指头在下,垂直往上顶,即可卸下适配器。切忌用力左右摇晃。请联系QQ:85452068索取相关演示视频。
Q. 你们的适配器可以跟我现有的涡旋仪兼容吗?
A.可能。我们的适配器数虽然设计搭配MOBIO的Vortex-Genie®; 一起使用,但一些其它涡旋仪也可能可以兼容。Fisher的涡旋仪型号是:02-215-365~ 02-215-376,还有VWR牌子的58816-121。也许其它型号的涡旋仪也使用,详情请咨询技术支持。
Q. 我有Precellys®24,MoBio的PowerSoil® DNA Isolation Kit可用搭配使用吗?
A. 可以的。虽然PowerSoil® DNA Isolation Kit专门优化配合MOBIO的PowerLyzer™ 使用,但也是可以用其它高速强力珠磨研磨设备的。详见说明书速度转换表。
Q. 我有FastPrep®24,MoBio的PowerSoil® DNA Isolation Kit可用搭配使用吗?
A. 可以的。虽然PowerSoil® DNA Isolation Kit专门优化配合MOBIO的PowerLyzer™ 使用,但也是可以用其它高速强力珠磨研磨设备的。详见说明书速度转换表
arrow DNA回收
Q. 使用UltraClean PCR Clean-up Kit回收DNA最小片段是多少?
A. 60bp
Q. 使用UltraClean PCR Clean-up Kit回收DNA最大片段是多少?
A. 最大10kb.
Q. UltraClean PCR Clean-up Kit会去除引物二聚体吗?
A. 是的。小于50bp的DNA片段都会被清除掉。
Q. 我需要回收大于10kb的DNA片段。有没有合适的试剂盒?
A. 有的。回收片段大于10kb的DNA,你可以用基于硅胶滤膜的UltraClean15(货号12100-300)
Q. UltraClean PCR Clean-up Kit回收PCR反应物,去除的都是哪些东西?
A. 盐、引物、dNTP、radio-labels和酶
Q. UltraClean PCR Clean-up Kit一次能回收多少DNA/PCR产物?
A. 经测试,硅胶滤膜DNA吸附上限是20μg。
Q. 使用UltraClean PCR Clean-up Kit只能回收到很少或者甚至没有DNA。怎么回事?
A. 好几个地方都可能影响到。SpinBind使用前必须剧烈摇匀。是否有考虑到洗脱过程?SpinClean Wash Buffer的主要成分乙醇可能会挥发导致DNA提前洗脱。尝试用新鲜SpinClean重新配制溶液。
Q. 我的260/230比值很低(低于1.0),怎么回事?
A. 可能是胍盐污染。冲洗过滤柱时,尝试延长离心时间至2-5min。
arrow 血液
Q. 我可以用BiOstic Blood Total RNA Isolation kit提取袖套细胞/白细胞沉淀RNA吗?
A. 是的,你可以用BiOstic Blood Total RNA Isolation Kit提取袖套细胞或白细胞沉淀RNA。直接跳到步骤五,开始白细胞裂解。用300μl BR2溶液(含bME)充分重悬沉淀细胞团。
Q. 哪款试剂盒最适合用来提取支原体?
A. 支原体缺乏细胞壁,因此无需机械裂解。推荐使用UltraClean BloodSpin DNA Isolation Kit。
arrow DNA纯度、得率检测及保存
Q. 提取后的DNA 260/230比值偏低(<1.5),为什么会这样?
A. 盐酸胍污染是最常见引起230nm吸光度偏高的原因。此盐溶液可帮助DNA吸附到过滤柱上。尝试用冲洗缓冲液再次洗涤过滤柱。另一个引起260/230比值偏低的原因是抑制因子污染。若340nmn吸光值 > 0.1,则很有可能PCR等下游实验已经无办法进行。使用MO BIO PowerClean® DNA Clean-Up kit可高效去除抑制因子。
Q. MO BIO的试剂盒中的洗脱缓冲液含有EDTA吗?
A. 并非所有的客户希望洗脱液中含有EDTA,所以我们只加入了Tris。为了延长DNA保存时间,你可以根据需要加入适当EDTA,使其最终浓度为1mM。请注意,EDTA会影响下游酶反应。10倍稀释DNA可去除EDTA对酶反应的抑制作用。
Q. 我加样跑电泳时,DNA/RNA总是飘上来加不进去。怎么办?
A.提取过程中,冲洗好spin filter上的DNA/RNA后,需要离心几分钟甩干过滤柱。若过滤柱未被充分甩干,残留的酒精会使得样品比重变轻而无法沉入电泳孔底。可通过标准的DNA浓缩程序去除其中的酒精污染。
Q. 提取的土壤DNA 340nm吸光度偏高(>0.1)。为什么?
A. 刚提取的土壤DNA 340nm吸光度偏高,结合260/230(< 1.5) 偏低,表示腐植酸污染。下游PCR等工作有可能会被抑制。若PCR无法进行,尝试10倍稀释DNA原溶液。也可以用MO BIO PowerClean® DNA Clean-Up kit,在尽量少地损失DNA的情况下高效去除抑制因子。详细试验报告点击这里
arrow RNA
Q. RNA提取试剂盒可以回收像micro RNA 和siRNA这样的小分子RNAs吗??
A. 可以的,只要稍微修改一下说明书即可。标准的绑定液是由一份体积的绑定溶液(不同试剂盒,有可能是PM3、PR3、PWR3或BFR4),1体积100%乙醇,1体积裂解物,组成1:1:1混合物。为了减少RNA分子的剪切,你需要增加一份100%乙醇,混合物比例变成1:2:1。这样,你就可以回收到样品中的绝大部分RNA了。详情请点击相应博文

 

 

 

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