PowerPlant® DNA Isolation kit
强力植物®Pro DNA提取试剂盒
简介
PowerPlant® Pro DNA Isolation Kit专门用于从植物细胞、组织、种子等中快速简便地提取总DNA。采用的珠磨研磨法取代传统累赘的CTAB法、苯酚发、氯仿法,从包括草莓叶、棉花叶、棉花种子和松针叶等顽固难提样品高质量DNA。PowerPlant®
Pro DNA Isolation Kit在提取过程中还使用了专利的抑制因子去除技术®(IRT)来去除所有PCR抑制因子,最终DNA可直接用于PCR、qPCR和测序等下游实验。
配合PowerLyzer™24高速研磨机使用:
试剂盒中Bead
Tubes预灌2.38mm不锈钢研磨珠,若需要其它类型的研磨珠套管请参阅
http://www.anbiosci.com/products/bead%20beating%20tubes.htm。
具体使用参数请查阅下文操作步骤。
配合其它高速研磨机:
在FastPrep®或Precellys®上使用本试剂盒循环参考:
PowerLyzer™24 |
Fastprep 24m/s |
Precellys24 |
500 |
- |
- |
600 |
- |
- |
700 |
- |
- |
800 |
- |
- |
900 |
- |
- |
1000 |
- |
- |
1100 |
- |
- |
1200 |
- |
- |
1300 |
- |
- |
1400 |
- |
- |
1500 |
- |
- |
1600 |
- |
- |
1700 |
- |
- |
1800 |
- |
- |
1900 |
- |
- |
2000 |
- |
- |
2100 |
- |
- |
2200 |
- |
- |
2300 |
- |
- |
2400 |
- |
- |
2500 |
4 |
5000 |
2600 |
- |
5200 |
2700 |
- |
5400 |
2800 |
4.5 |
5600 |
2900 |
- |
5800 |
3000 |
- |
6000 |
3100 |
5 |
6200 |
3200 |
- |
- |
3300 |
- |
- |
3400 |
5.5 |
- |
3500 |
- |
- |
3600 |
- |
- |
3700 |
-6 |
- |
3800 |
- |
- |
3900 |
- |
- |
4000 |
-6.5 |
- |
4100 |
- |
- |
4200 |
- |
- |
4300 |
- |
- |
4400 |
- |
- |
4500 |
- |
- |
5000 |
- |
- |
*Fastprep®及Precelly®无法设置低于2500rpm或高于4000rpm的转速范围。
多糖多酚分离溶液(PSS)
建议给富含多糖多酚的植物样品提取过程中添加多糖多酚分离溶液。
DNA平均得率
植物组织的类型、年龄以及多酚含量会影响DNA提取得率。下面是几种植物样品使用PowerPlant®Pro DNA Isolation Kit提取的平均DNA得率:
植物样品 |
DNA得率(50mg样品) |
PSS |
葡萄叶 |
2.5-3.5μg |
+ |
草莓叶 |
10-15μg |
+ |
番茄茎 |
10-25μg |
+ |
棉花叶 |
2.5-3.5μg |
+/ - |
棉花种子 |
20-25μg |
- |
草叶 |
40-50μg |
+ |
松针 |
30-35μg |
- |
薄荷叶 |
2-3μ |
- |
*+,添加PSS有助提高得率;-,添加PSS得率下降;+/ -,是否添加PSS不影响得率。
设备要求
微型离心机(16000g)
移液器(50μl~600μl)
Vortex-Genie®2 涡旋仪(MO BIO货号#13111-V-220)或PowerLyzer™24或其它高速研磨机
涡旋仪适配器(MO
BIO货号#13000-V1或13000-V1-24)
相关产品 |
货号 |
提取次数 |
UltraClean
-htp 96 Well Plant DNA Isolation Kit |
13096-4\13096-12 |
4×96次\12×96次 |
UltraClean®
Plant RNA Isolation Kit |
13300-20
13300-50 |
20次
50次 |
PowerLyzer™
UltraClean® Plant RNA Isolation Kit |
13355-50 |
50次 |
PowerPlant®
RNA Isolation Kit |
13500-50 |
50次 |
PowerPlant®
RNA Isolation Kit with DNase |
13550-50 |
50次 |
PowerLyzer™
24 Homogenizer |
13155 |
一套 |
Vortex
Adapter, holds 24 (1.5-2.0 ml) tubes |
13000-V1-24 |
一个 |
试剂盒组分
|
货号:13400-50 |
组分 |
量 |
Solution
PD1 |
25ml |
Solution
PD2 |
3ml |
Solution
PD3 |
14ml |
Solution
PD4 |
32ml |
Solution
PD5 |
28ml |
Solution
PD6 |
2×30ml |
Solution
PD7 |
5.5ml |
RNase
A Solution (25 mg/ml) |
165μl |
Phenolic
Separation Solution |
2.2ml |
PowerPlant®
Bead Tubes |
50 |
Spin
Filters |
50 |
2
ml Collection Tubes |
150 |
△实验前请先逐一检查试剂!
保存
RNase A 4℃保存。其它组分室温(15-30℃)保存。
操作步骤:
1、往PowerPlant®Bead Tubes加入50mg植物样品及450μl PD1溶液。
【注意:若使用PSS溶液处理富含多酚样品(参照"DNA平均得率"),PD1溶液改用410μl,PSS溶液用40μl。】
这一步发生了什么:植物样品加到Tube管中准备研磨。PSS溶液把多酚与核酸分离开,后续抑制因子去除(IRT)步骤多酚降被去除。
2、使用前检查PD2是否沉淀,发生沉淀可37℃-55℃水浴溶解。加50μlPD2。
这一步发生了什么:PD2溶液含SDS。低温会发生沉淀。水浴后可趁热使用。
3、加入3μl RNase
A溶液,稍微涡旋混匀。
这一步发生了什么:下面研磨过程中RNase A将消化样品中的RNA。
4、使用下列方法中的一种研磨样品:
A.涡旋仪:
把PowerPlant®Bead
Tubes按在涡旋仪适配器(MO
BIO货号:13000-V1或13000-V1-24)上。连续涡旋振荡10min。
B.PowerLyzer™24研磨:
1.、记号笔给PowerPlant®Bead Tubes的帽子和外壁都标记样品编号
【注意:鉴于PowerLyzer™24的强大外力,Tube帽子上的标记可能会被磨掉。建议给Tube管帽子和外壁都进行标号。】
2、把PowerPlant®Bead Tubes放入到PowerLyzer™24的Tube
Holder中。所有Tube管包括空位上的都必须配平。根据样品选择合适的速度,1次循环研磨2min。
植物样品类型 |
速度 |
循环次数 |
时间/循环 |
柔软叶片组织 |
2000RPM |
1 |
2min |
富含纤维叶片组织 |
2200RPM |
1 |
2min |
茎 |
2200RPM |
1 |
2min |
根 |
2500RPM |
1 |
2min |
松针 |
2600RPM |
1 |
2min |
种子 |
2800RPM |
1 |
2min |
注意:最高研磨速度必须限制在上述指导速度的上限内,超出上限有可能导致PowerPlant®Bead
Tubes破裂或渗漏。
这一步发生了什么:珠磨研磨法无需手工费劲研磨快速均质植物组织。某些情况下植物样品在规定研磨时间和循环后可能不能完全破碎,但此情况不影响获得理想DNA得率。
5、Bead Tubes 13000g离心2min。
这一步发生了什么:离心沉淀不要的细胞组织碎片。
6、把上清转移到一个干净的2ml Collection
Tube(试剂盒提供)中。
【注意:根据样品类型,50mg的样品大约可获得450-550μl上清。上清中可能带有少量细胞碎片。】
这一步发生了什么:上清含有DNA已经其它细胞成分。尽量避免吸取到底部沉淀。
7、加入175μl PD3溶液。4℃孵育5min。
【注意:难提的样品此步PD3可增加到250μl。一般样品175μl即可。】
这一步发生了什么:PD3是创新的抑制因子去除技术(IRT)的重要组成之一,这步充分去除样品中的PCR抑制因子。
8、13000g离心2min。
这一步发生了什么:离心沉淀蛋白与腐植酸成分。
9、避开沉淀,转移600μl上清到一个新的2ml Collection Tube(试剂盒提供)中。
10、加入600μl PD4溶液和600μl PD6溶液。涡旋5s混匀。
这一步发生了什么:PD4为绑定盐溶液,其浓度及组分能使DNA选择性地吸附到硅胶离心柱上。PD6为含酒精的缓冲液,可使最大化绑定核酸到离心柱。
11、加载600μl上溶液到一个Spin Filter上,10000g离心30s。弃去滤液,Spin Filter重新放回到Tube管中,再加载600μl上溶液,然后离心,弃去滤液。重复步骤直到过滤完所有溶液。
这一步发生了什么:PD4和PD6溶液的共同作用下,DNA选择性地吸附到Spin Filter上。
12、加入500μl PD5溶液到Spin Filter离心柱中。10000g离心30s。弃去滤液。Spin Filter放回到Tube管中。
这一步发生了什么:PD5为含酒精冲洗缓冲液,可去除滤膜上残留的盐分及其它杂质。
13、加入500μl PD6溶液到Spin Filter离心柱中。10000g离心30s。弃去滤液,把Spin Filter放回到Tube管中。
这一步发生了什么:PD6溶液溶液为含酒精缓冲液,可进一步去离心柱滤膜上残留的盐分及其它杂质。
14、16000g再离心2min,去除残余的PD6溶液。
这一步发生了什么:重要步骤!进行下一步强必须清除残留冲洗缓冲液。
15、把Spin Filter转移到一个新的2ml Collection Tube(试剂盒提供)中。避免沾到任何PD6溶液。
16、加入50-100μl PD7(10mM Tris,pH8.0)到离心柱滤膜中间,室温孵育2min。
17、10000g离心30s。
【注意:为了最大化地洗脱,可把滤液冲洗加到白色滤膜上,10000g再离心30s。】
这一步发生了什么:PD7为10mM Tris,pH8.0。低盐缓冲液重溶洗脱滤膜上吸附的DNA,中心pH有主意保存过程中保护DNA。
18、弃去Spin Filter。洗脱液中的DNA可直接用于下游实验,无需进一步处理。
DNA建议-20℃保存。PD7溶液不含EDTA。
疑点难点
珠磨研磨前样品加热
根据物种不同或某些植物部位,在添加PD1/PD2溶液前需要稍微加热,而可选溶液PSS使用前有时也需要65℃水浴10min溶解沉淀。实验发现大部分叶片、草叶、松针提取DNA前无需加热。具体样品请通过试验评估做出选择。
研磨力度
有些植物样品比建议或少或多的研磨速度和时间,请根据具体样品做出适当调整。
DNA保存
洗脱在PD7(1mM Tris,pH8.0)溶液中的DNA -20℃保存。也可以用TE(货号:17325-1000)或TE-4(10mM Tris,0.4mM EDTA,货号17320-1000)洗脱。
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